Akrabalarının yanında kalan Mary, bir gün iki kedinin peşine takılınca ormanın içinde tuhaf bir çiçek bulur. Kısa süre sonra bu çiçeğin sıradan olmadığını, insana büyülü güçler verdiğini anlar. Yolda karşısına çıkan küçük süpürge sopası da hareket etmeye başlayınca Mary kendini bir anda ağaçların üzerinden, bulutların arasına doğru savrulmuş halde bulur. Süpürge onu, yetenekli cadıların çalıştığı Endor Üniversitesi’ne götürür. Mary burada kafeslere kapatılmış, üzerlerinde korkunç deneyler yapılmış hayvanları görünce büyük bir şaşkınlık yaşar. Üstelik siyah kedi Tib de tutsaklar arasındadır. Ertesi gün okula geri dönen Mary, Bayan Pumblechook ve Doktor Dee’ye yakalanmadan hayvanları serbest bırakır. Bu film, Mary’nin kaçışıyla birlikte giderek gerilen bir kovalamacaya açılır.
