Amerikan Marşal’ı Teddy Daniels, ortağıyla birlikte Shutter Island’daki yüksek güvenlikli akıl hastanesine gelir. Burada, tehlikeli suçluların tutulduğu kapalı ve tedirgin edici bir düzen vardır. Başta sıradan gibi görünen soruşturma, Teddy adada kaldıkça giderek daha karanlık bir hal alır. Hastane çalışanlarının tavırları, adanın izole yapısı ve ortaya çıkan ipuçları, onun aklındaki soruları çoğaltır. Teddy, gerçeğe yaklaştığını düşündüğü her anda daha rahatsız edici ayrıntılarla karşılaşır. Film, bir kayıp vakasının peşinden giderken karakterin zihnindeki çatlakları ve adanın bastırılmış sırlarını adım adım hissettirir. Bazı yerlerin, insan oradan ayrılsa bile peşini bırakmadığını sezdiren gergin bir hikâye anlatır.
