Scooby-Doo ve Sırlar Şirketi, Daphne’nin kuzeni Fiona’yı ziyaret etmek için İskoçya’ya gider. Fiona, Loch Ness kıyısındaki Blake Castle’da yaşamaktadır ve son günlerde efsanevi Nessie’nin çevrede görülmesi herkesi huzursuz etmiştir. Ekip, yaratığın gerçekten var olup olmadığını anlamaya çalışırken Penelope Miller adlı bilim insanıyla tanışır. Miller, yıllar önce canavarı gördüğünü söylemiş, ardından İskoçya Doğa Tarihi Müzesi’ndeki işini bırakıp onu yakalamaya kendini adamıştır. Bu sırada Scooby-Doo ve Shaggy, farkında olmadan beklenmedik bir atletik başarı gösterince Highland Oyunları’na katılmaları için ikna edilir. Üstelik bu yıl oyunlar Blake Castle’da yapılacaktır. Tabii Nessie ortaya çıkıp her şeyi karıştırmazsa. Film, klasik Scooby-Doo gizemini İskoçya atmosferiyle birleştiriyor.
