Eski bir suikastçı olan Kenshin Himura, geçmişinin gölgesini taşısa da artık kılıcını başka bir amaç için kullanmaktadır. Karşısında ise acımasızlığıyla tanınan Makoto Shishio vardır. Shishio, Meiji hükümetini hedef alan saldırılarıyla ülkeyi büyük bir karmaşanın eşiğine getirir. Kenshin’in bu tehdide karşı durması, yalnızca kendi hesaplaşması değil, aynı zamanda ülkenin geleceği için de kritik bir sınavdır. Film, Kenshin’in sakin görünümünün ardındaki savaşçı tarafı ile Shishio’nun durdurulması zor hırsını karşı karşıya getiriyor. Aksiyonun ağırlıkta olduğu hikâyede mesele sadece kılıç kullanma becerisi değil; Kenshin’in neyi, ne pahasına savunacağıdır. Kyoto’da yükselen gerilim, karakterler arasındaki mücadeleyi daha da sertleştirir.
